Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
RxraP28700 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RxraP28700 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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RxraP28700 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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