Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm11875-201ENSMUST00000118187 799 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm6285-201ENSMUST00000122012 498 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm12551-201ENSMUST00000122073 726 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm14250-201ENSMUST00000148458 566 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm7893-201ENSMUST00000189666 225 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm42836-201ENSMUST00000197198 728 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 AC140264.1-201ENSMUST00000220023 469 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 AC118250.2-201ENSMUST00000228890 416 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Snora17-201ENSMUST00000104004 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 n-R5s23-201ENSMUST00000122523 115 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm2666-201ENSMUST00000160587 891 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Mir5108-201ENSMUST00000175276 85 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm6593-201ENSMUST00000211165 1135 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Gm45824-201ENSMUST00000212236 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms