Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 AC127596.1-201ENSMUST00000214721 2415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Acox2-201ENSMUST00000022271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Rnf6-208ENSMUST00000169407 3276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Nsun3-201ENSMUST00000063089 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Rad51ap1-201ENSMUST00000112220 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Spn-201ENSMUST00000049931 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Txk-202ENSMUST00000169534 2344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Fgr-204ENSMUST00000171223 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Lias-201ENSMUST00000031101 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gabpb2-203ENSMUST00000107204 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 A930002I21Rik-201ENSMUST00000060946 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Sez6-201ENSMUST00000000646 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 C2cd5-202ENSMUST00000111758 4062 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm5760-201ENSMUST00000119692 1002 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm24912-201ENSMUST00000157291 117 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm17359-201ENSMUST00000164216 778 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm7352-201ENSMUST00000167577 1192 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm8266-201ENSMUST00000179745 1192 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm26810-201ENSMUST00000181153 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm8992-201ENSMUST00000204463 502 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm9662-201ENSMUST00000216748 1206 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Gm8435-201ENSMUST00000219481 792 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Fam209-201ENSMUST00000029007 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Olfr1184-201ENSMUST00000050038 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm28038F7BCN9 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms