Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm10043-201ENSMUST00000210691 235 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm37649-201ENSMUST00000192079 2232 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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