Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rpl32-201ENSMUST00000081840 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm12004-201ENSMUST00000117869 718 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm10577-201ENSMUST00000097954 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Smim18J3QNP2 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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