Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Rhox4c-201ENSMUST00000115183 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm22484-201ENSMUST00000157992 306 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Cldn34c3J3QJW5 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms