Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 4930579G18Rik-201ENSMUST00000167763 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8976-201ENSMUST00000187136 703 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem147-207ENSMUST00000209065 727 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 CT025535.1-202ENSMUST00000228291 241 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 9330161L09Rik-201ENSMUST00000056140 999 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zeb2-215ENSMUST00000200844 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr462-202ENSMUST00000213672 2021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Car13-201ENSMUST00000029071 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g2d-202ENSMUST00000105806 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12508-201ENSMUST00000121282 480 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15942-201ENSMUST00000136305 810 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg17-208ENSMUST00000154242 346 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mir378b-201ENSMUST00000175244 92 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Eras-201ENSMUST00000033500 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Upf2-201ENSMUST00000060092 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms