Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
RxraP28700 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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