Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Rnft1Q9DCN7 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Rnft1Q9DCN7 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Rnft1Q9DCN7 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Rnft1Q9DCN7 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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