Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm43809-201ENSMUST00000200694 338 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gfi1P70338 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms