Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ncor1-202ENSMUST00000037575 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm38123-201ENSMUST00000194990 2779 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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