Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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