Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
RxraP28700 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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