Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp473-201ENSMUST00000060270 3800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm14799-201ENSMUST00000117502 429 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rpl17-ps8-201ENSMUST00000118924 621 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9051-201ENSMUST00000119335 1035 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15410-201ENSMUST00000127763 544 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ccl19-203ENSMUST00000140546 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm16235-201ENSMUST00000146132 342 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7893-201ENSMUST00000189666 225 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Krtap14-202ENSMUST00000189774 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43079-201ENSMUST00000199794 559 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45877-201ENSMUST00000212110 564 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm5173-201ENSMUST00000219616 950 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm8153-201ENSMUST00000219844 952 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC124687.4-201ENSMUST00000222361 463 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm8278-201ENSMUST00000222840 1121 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Fxyd2-201ENSMUST00000041005 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ucn2-201ENSMUST00000052724 1155 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Klk1b1-201ENSMUST00000078835 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Defb23-201ENSMUST00000099206 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4930533K18Rik-203ENSMUST00000219192 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Serpina1c-201ENSMUST00000074051 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm21129-201ENSMUST00000185932 2560 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29258-201ENSMUST00000186842 2564 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms