Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm24257-201ENSMUST00000104472 131 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
H2-Eb1P04230 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms