Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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