Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm16238-201ENSMUST00000159343 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm7384-201ENSMUST00000203682 530 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm44033-201ENSMUST00000203699 695 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm18058-201ENSMUST00000207385 492 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Snora61-201ENSMUST00000083015 130 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 AC160550.2-202ENSMUST00000227812 1861 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Higd1aQ9JLR9 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms