Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Scfd1-205ENSMUST00000219434 2749 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Gm21863J3KMP8 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms