Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tshz2-201ENSMUST00000109157 5083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm39121-201ENSMUST00000208847 525 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Lrtm1-202ENSMUST00000224708 1646 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Muc2-201ENSMUST00000026590 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Cphx2-201ENSMUST00000168149 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ScaperF8VQ70 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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