Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Csmd2V9GX34 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd2V9GX34 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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