Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vstm4T1NXB5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms