Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vamp5Q9Z2P8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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