Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rlbp1Q9Z275 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rlbp1Q9Z275 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rlbp1Q9Z275 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms