Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn7Q9Z261 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Cldn7Q9Z261 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms