Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn8Q9Z260 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms