Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ap3b1Q9Z1T1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ap3b1Q9Z1T1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms