Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VarsQ9Z1Q9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms