Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ddx39bQ9Z1N5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms