Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nup160Q9Z0W3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nup160Q9Z0W3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms