Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bgrQ9WUZ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms