Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf7Q9R1C0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Taf7Q9R1C0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf7Q9R1C0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms