Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trex2Q9R1A9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trex2Q9R1A9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms