Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0P4

Smap, Small acidic protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmapQ9R0P4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SmapQ9R0P4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SmapQ9R0P4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SmapQ9R0P4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SmapQ9R0P4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SmapQ9R0P4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms