Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zeb2Q9R0G7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zeb2Q9R0G7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms