Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod2Q9R0B9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod2Q9R0B9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms