Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsjQ9R014 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms