Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VapbQ9QY76 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VapbQ9QY76 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms