Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Limd1Q9QXD8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Limd1Q9QXD8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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