Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Reep6Q9JM62 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms