Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CubnQ9JLB4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CubnQ9JLB4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CubnQ9JLB4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms