Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Riox1Q9JJF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Riox1Q9JJF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms