Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2ird1Q9JI57 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms