Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RabggtaQ9JHK4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RabggtaQ9JHK4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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