Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dap3Q9ER88 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dap3Q9ER88 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms