Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col4a3bpQ9EQG9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col4a3bpQ9EQG9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col4a3bpQ9EQG9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms