Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn1Q9EPL2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn1Q9EPL2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms