Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt112Q9DCG9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt112Q9DCG9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms