Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xab2Q9DCD2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xab2Q9DCD2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms