Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms