Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfaip8l2Q9D8Y7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms